1999–2000

Sau I Am Sam (2001), tài năng của cô đã được công nhận trên toàn thế giới. Dakota thẳng bước đến với Trapped (2002) trong vai Abby Jenning, bên cạnh Charlize Theron, và đóng vai lúc nhỏ của Reese Witherspoon trong phim Sweet Home Alabama (2002). Nhưng Dakota vẫn còn nhiều hơn 2 phim để đóng vào năm 2002. Đầu tiên, cô được giao nhiệm vụ tường thuật cho bộ phim khoa học "Taken" (2002) của đạo diễn Steven Spielberg, một vài series truyền hình mini, và chi tiết nó gồm 10 chương chia thành từng phần 1.Đây đã từng là thử thách nho nhỏ, nhưng chính cô bé đã làm cho nó nổi bật hơn bao giờ hết. Bộ phim cuối năm 2002 của Dakota thuộc thể loại phim thiếu nhi, có tên là Hansel & Gretel (2002) trong vai Katie.[15]

Năm 2003 là năm thành công rực rỡ của Dakota, cô nhận được vai chính trong những dự án hấp dẫn. Đầu tiên là Sally Wadden trong "The Cat in the Hat" (2003) cùng với Mike Myers, tiếp đó thủ vai Lorraine "Ray" Schleine là cô bé bình thường trong bộ phim hài lãng mạn Uptown Girls (2003) bên cạnh Brittany Murphy. Cô còn tham gia lồng tiếng trong "Kim Possible: A Sitch in Time".

2004–2007

Trong năm 2004, Dakota xuất hiện trong bộ phim ly kỳ, bạo lực, Man on Fire (2004), bên cạnh Denzel Washington. Và được đánh giá cực kỳ xuất sắc trong bộ phim này. Đầu năm 2005 là phim Nine Lives (2005), trong vai Maria, tiếp đó là 1 vai diễn gây ớn lạnh trong Hide and Seek (2005) bên cạnh Robert De Niro. Cho đến thời điểm đó, cô là sao nhí nhỏ tuổi nhất, bận rộn nhất ở Hollywood. Em gái của Dakota là Elle Fanning, cũng khẳng định tài năng diễn xuất vài năm sau đó.

Sau Hide and Seek (2005) đến War of the Worlds (2005) nó là một bộ phim lớn nhất em từng được tham gia. Bộ phim không chỉ khiến Dakota được nhớ đến nhiều hơn, mà còn giúp cô có cơ hội được đóng vai con (trong phim) của nam diễn viên A-list Hollywood:Tom Cruise. Bộ phim đã rất thành công ở bốn thị trường chính, đầu tiên ởTokyo, Nhật bản, thứ hai ở Pháp, thứ ba ở London, Anh và thứ tư ở New York, Mỹ. Các cuộc bình luận đều đánh giá xuất sắc, đặc biệt là Dakota. Cô còn lồng tiếng Lilo trong phim Lilo & Stitch 2: Stitch Has a Glitch (2005) (V), mà em vừa hoàn thành.

2008–nay

Dakota Fanning nhận vai ma cà rồng nhỏ tuổi Jane trong phần 2 của bộ phim ăn khách Chạng vạng mang tên Trăng non. Nhân vật của Dakota có khả năng làm cho người khác đau đớn ngay cả khi không chạm vào người đó. Trăng non ra mắt vào ngày 20/10 và Dakota Fanning cũng xuất hiện trên tạp chí Teen Vogue tháng 12/2009 để quảng cáo. Dakota Fanning tiết lộ, nhờ đóng phim Trăng non, cô đã trở nên thân thiết với Kristen Stewart, người thủ vai chính Bella Swan trong phim. Dakota Fanning nói cô nhận lời tham gia Trăng non không cần đắn đó suy nghĩ bởi bản thân cô là fan của phim Chạng vạng.

Kristen Stewart và Dakota Fanning không chỉ đóng cùng nhau trong phim Trăng non mà còn đóng cùng trong bộ phim The Runaways - bộ phim dự định công chiếu vào năm 2010. Mới đây 'Quyền lực nhí' của Hollywood này đã xuất hiện vô cùng xinh đẹp và rạng rỡ trong chương trình nổi tiếng The Late Show của truyền hình Mỹ để trả lời phỏng vấn trực tiếp về cuộc đời và sự nghiệp của cô.